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Mieux identifier les maladies infectieuses et sauver des vies


Nouvelle procédure pour le diagnostic des maladies infectieuses
Chaque année, les maladies infectieuses sont la cause de millions de décès dans le monde, une grande partie de ces infections étant causées par des infections dites à biofilm, qui ont jusqu'à présent été difficiles à diagnostiquer, rapporte le German Heart Center Berlin. Avec une nouvelle méthode, les options de diagnostic - et donc aussi les options de traitement - pourraient être considérablement améliorées à l'avenir.

Les maladies infectieuses font partie des dix principales causes de décès en Europe et nombre de ces maladies sont dues à des infections dites à biofilm. Dans de tels cas, le diagnostic a jusqu'à présent été extrêmement difficile. Dans le cadre du projet commun iSOLID, financé par le ministère fédéral de l'Éducation et de la Recherche (BMBF), "la détection rapide et fiable de telles infections à l'aide de diagnostics d'images numériques" doit maintenant être étudiée. Les recommandations de thérapies adaptées sont également l'objectif du projet collaboratif.

Les infections à biofilm sont particulièrement difficiles à détecter
Dans le cadre du projet commun iSOLID (Integrated Solutions for Infection Detection), le centre de biofilm du centre cardiaque allemand de Berlin, le Fraunhofer Institute for Integrated Circuits IIS, HB Technologies AG et CHILI GmbH travaillent ensemble sur de nouvelles solutions pour le diagnostic des infections à biofilm. En utilisant le diagnostic d'image numérique, les infections devraient être diagnostiquées plus rapidement et de manière plus fiable. Les infections à biofilm sont responsables d'une proportion importante de maladies infectieuses graves, mais jusqu'à présent, il n'existe pas de méthodes de diagnostic appropriées pour leur détection et leur traitement ciblé, rapporte le centre cardiaque allemand de Berlin.

Méthode FISH pour la détection des bactéries
Les chercheurs utilisent la soi-disant «hybridation in situ par fluorescence» (FISH) comme méthode de diagnostic, qui est basée sur des sondes ADN marquées par fluorescence et, selon les experts, combine les avantages de la biologie moléculaire, de la microscopie par fluorescence et de l'histologie. Ceci est destiné à permettre le diagnostic spécifique des maladies infectieuses qui peuvent être retracées aux biofilms. "Grâce à l'examen FISH, les biofilms sont systématiquement visibles et détectables pour la première fois", souligne le Dr. Annette Moter du centre cardiaque allemand de Berlin. Avec la méthode, les bactéries impliquées dans l'infection peuvent être détectées et identifiées afin qu'une thérapie spécifique puisse être initiée rapidement, rapporte l'expert. Une détection rapide et spécifique des agents pathogènes est essentielle pour le bon choix de l'antibiothérapie.

Développement de nouvelles méthodes de prévention et de traitement
Bien que la méthode FISH soit déjà connue, elle repose sur de très grandes quantités de données d'images, dont l'analyse est complexe et complexe. Dans le cadre du projet collaboratif actuel, une méthode numérique d'analyse d'images pour la détection et la quantification automatiques des micro-organismes doit être développée. La "solution d'intégration de flux de travail et de traitement des échantillons pour l'analyse quantitative des biofilms pour le développement de nouvelles méthodes de prévention et de traitement" sont également les objectifs du projet. À l'aide d'un système de communication et d'archivage d'images (PACS) à commande intuitive, tous les fichiers d'image pertinents doivent être enregistrés et traités rapidement et en toute sécurité, rapporte le German Heart Center Berlin.

Dans un premier temps, il est maintenant prévu de tester les méthodes souhaitées dans le projet conjoint iSOLID sur des échantillons de tissus cliniques et également d'évaluer le flux de travail correspondant dans le cadre d'une étude diagnostique. Par la suite, des possibilités structurelles doivent être créées afin «d'utiliser systématiquement la méthode FISH au niveau national et international, comblant ainsi une lacune dans le diagnostic des maladies infectieuses», rapportent les scientifiques. (fp)

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